Endoskopi mide ve bağırsak üzere içi boş organların hastalıklarının teşhis ve tedavisinde kullanılan bir sistemdir. Kolonoskopi, rektoskopi ve ERCP de endoskopik süreçler olsa da endoskopi yemek borusu, mide ve duodenumun incelenmesine imkan sağlayan bir prosedürü tabir eder. Endoskopi sırasında yemek borusu, mide ve duodenum ucunda ışık ve kamera bulunan ince silindirik bir aygıtla incelenir.